Molekulare Destillationist eine spezielle Flüssig-Flüssigkeits-Trenntechnologie, die sich von der herkömmlichen Destillation unterscheidet, die auf dem Prinzip der Siedepunktdifferenztrennung beruht. Hierbei handelt es sich um einen Prozess der Destillation und Reinigung von wärmeempfindlichem Material oder Material mit hohem Siedepunkt unter Ausnutzung der unterschiedlichen freien Weglänge der molekularen Bewegung unter Hochvakuum. Wird hauptsächlich in den Bereichen Chemie, Pharmazie, Petrochemie, Gewürze, Kunststoffe und Öl sowie in anderen Industriebereichen eingesetzt.
Das Material wird vom Zufuhrgefäß zum Hauptdestillations-Ummantelungsverdampfer überführt. Durch die Rotation des Rotors und die kontinuierliche Erwärmung wird die Materialflüssigkeit in einen extrem dünnen, turbulenten Flüssigkeitsfilm geschabt und spiralförmig nach unten gedrückt. Beim Absinken beginnt das leichtere Material (mit niedrigem Siedepunkt) in der Materialflüssigkeit zu verdampfen, sich zum internen Kondensator zu bewegen und zu einer Flüssigkeit zu werden, die in den Auffangkolben für die leichte Phase abfließt. Schwerere Materialien (wie Chlorophyll, Salze, Zucker, Wachs usw.) verdampfen nicht, sondern fließen stattdessen entlang der Innenwand des Hauptverdampfers in den Auffangkolben für die schwere Phase.